Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarce1O54941 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarce1O54941 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms