Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1aO35526 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1aO35526 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms