Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Notch2O35516 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Notch2O35516 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Notch2O35516 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Notch2O35516 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms