Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfra2O08842 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra2O08842 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms