Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MsmbO08540 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MsmbO08540 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MsmbO08540 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MsmbO08540 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms