Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm8050L7N2E3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8050L7N2E3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8050L7N2E3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms