Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6871L7N248 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms