Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Gm379J3QQ19 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm379J3QQ19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm379J3QQ19 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gm379J3QQ19 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm379J3QQ19 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm379J3QQ19 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm379J3QQ19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Gm379J3QQ19 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Gm379J3QQ19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm379J3QQ19 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm379J3QQ19 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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