Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm21972J3QN38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm21972J3QN38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm21972J3QN38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm21972J3QN38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm21972J3QN38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Gm21972J3QN38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gm21972J3QN38 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21972J3QN38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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