Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms