Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pot1bH7BX60 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pot1bH7BX60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pot1bH7BX60 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms