Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r12G5E8G1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r12G5E8G1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r12G5E8G1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r12G5E8G1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r12G5E8G1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms