Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
2610008E11RikG3X964 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610008E11RikG3X964 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms