Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc9a3G3X939 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc9a3G3X939 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc9a3G3X939 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms