Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Speer4cG3UXD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Speer4cG3UXD1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms