Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4aF8VPX6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4aF8VPX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4aF8VPX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms