Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dcdc2bF7BCK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dcdc2bF7BCK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dcdc2bF7BCK0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms