Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms