Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17093F6XGJ4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17093F6XGJ4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms