Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17555F6U8B9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17555F6U8B9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms