Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdhr2E9Q7P9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdhr2E9Q7P9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdhr2E9Q7P9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms