Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UtrnE9Q6R7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
UtrnE9Q6R7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UtrnE9Q6R7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms