Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgbd1E9Q492 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgbd1E9Q492 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms