Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r238E9Q373 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r238E9Q373 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms