Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrp3E9Q1T6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrp3E9Q1T6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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