Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd2E9PZM4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd2E9PZM4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd2E9PZM4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms