Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srp54bE9PXC0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.8 ms