Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimd1E9PW74 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gimd1E9PW74 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gimd1E9PW74 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms