Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim5E9PV98 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms