Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifit3bE9PV48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifit3bE9PV48 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms