Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp839E9PUU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms