Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444G20RikD3Z741 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930444G20RikD3Z741 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930444G20RikD3Z741 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms