Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930407I10RikD3Z5T8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930407I10RikD3Z5T8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms