Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif28pD3YXS5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif28pD3YXS5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms