Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc170D3YXL0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc170D3YXL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc170D3YXL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms