Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SafbD3YXK2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SafbD3YXK2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms