Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syce3B5KM66 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce3B5KM66 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms