Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4930402K13RikB1AW18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms