Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtpruB1AUH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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