Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fibcd1A2AV25 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fibcd1A2AV25 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms