Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rtf1A2AQ19 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtf1A2AQ19 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtf1A2AQ19 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms