Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ambra1A2AH22 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ambra1A2AH22 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ambra1A2AH22 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms