Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2dnl1A2AFH1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2dnl1A2AFH1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms