Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsg1A2A825 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsg1A2A825 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms