Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc173A0JLY1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc173A0JLY1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms