Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930469K13RikA0A286YDB2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms