Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms