Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Kcnj10-201ENSMUST00000056136 5407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Lif-201ENSMUST00000040750 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm43119-201ENSMUST00000196957 2122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm38066-201ENSMUST00000193223 1634 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm12826-201ENSMUST00000121841 379 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cep63-206ENSMUST00000162655 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Fgd3-201ENSMUST00000048716 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13535-201ENSMUST00000118714 1884 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Top3a-201ENSMUST00000002891 3741 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms