Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15470-201ENSMUST00000119135 1371 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45817-201ENSMUST00000212738 1757 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms