Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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